Hoewel bilaterale muziek en binaural beats overeenkomsten hebben, zijn er ook belangrijke verschillen tussen de twee. Binaural beats zijn een vorm van auditieve hersenstimulatie waarbij je in ieder oor een andere toon hoort. Je hersenen maken hier een derde toon van (de verschiltoon). De verschiltoon zorgt ervoor dat je hersenen in een staat komen waarin je je beter kunt focussen, ontspannen, minder angst ervaart, creatiever bent en beter kunt slapen.
Bilaterale muziek is gericht op het verbeteren van de communicatie tussen de twee hersenhelften door middel van afwisselende geluiden van links naar rechts.